実際に行ってみて分かったのですが、ジャングリアではアプリで取得する整理券とは別に「待ち列解放サービス」というまた別の整理券があるのでこちらを解説します。

整理券はプレミアムパス、アトラクション整理券、待ち列解放サービスの3種類。

1.プレミアムパス

1Dayチケットとは別に追加で購入する必要あり。購入する時にアトラクションを指定できるので体験したいアトラクションやショーを購入しておくと指定時間に並ばず優先的に乗ることができます。事前購入のほか、当日パーク入園後でも購入は可能ですが当日だと売り切れていて購入できなかったので早めの購入をおすすめします。
2.アトラクション整理券
アトラクション整理券は「整理券対象アトラクション」を楽しむための無料の整理券。
当日のパーク入場後、アプリから無料で先着取得できます。※注2

対象アトラクションでは、整理券を取得したゲストのみ体験できます。つまり、整理券を持っていないと列に並ぶことすらできません。整理券を取得すると、指定された時間帯にアトラクションを楽しめます。ただし、天気などによる運休により、指定の時間に体験できないことがあります。
実際にオープン2日目は雷雨によりパーク内で一時避難指示が出て2時間ほど全アトラクションが運休となりました。運休中の時間帯の整理券を持っていた方は結局アトラクションに乗れずその後の対応もありませんでした。
整理券対象アトラクション
- ホライゾン バルーン(※注1)
- スカイ フェニックス
- タイタンズ スウィング
- ツリートップ トレッキング
- スカイエンド トレッキング
- ヒューマン アロー
- バンジー グライダー
- トレジャー ファイト
- グラビティ ドロップ (運営開始遅延)
※注1 「ホライゾン バルーン」の利用方法が変更になりました
変更後の利用方法は、これまでの【時間指定方式】から、【フライトの条件がが整った際に番号順にお呼び出ししご案内する方式】となります。
当日のパークオープンより、ホライゾンバルーンのアトラクションエントランスにて利用登録をしてください。フライトの条件が整い次第、利用登録時の連絡先へ呼び出しがあります。連絡が来たら、ホライゾンバルーンにお戻りください。戻った方から順番に案内。
利用方法の変更に伴い、ホライゾンバルーンのプレミアムパスは今後販売いたしません。すでにプレミアムパスをお持ちの方は、一度「ホライゾンバルーンのアトラクションエントランス」にお越しください。優先的にご案内いたします。
公式案内の全文はこちら
※注2 現在アプリエラーにより配布方法が変更になっています
整理券の配布方法を【アプリでの配布】から【パーク内での現地配布】へと変更になりました。整理券は10時より「ジャングル エクストリームズ レセプション」にて配布。
取得を希望の方は、入場後に配布場所まで出向いてください。すぐなくなります。
※実際は10時よりも前に配布が始まっています。
※1人1枚のため必ず全員で行ってください。紙の整理券
公式HPの案内を随時チェックしてください
※プレミアムパスを購入した方はこちらのアトラクション整理券は必要ありません
3.待ち列解放サービス
待ち列解放サービス整理券がこちら

簡単にいうと今しばらくの間は列に並ばなくても良いという整理券。
60分以上の待ち時間が発生したアトラクション(上の整理券対象アトラクションは除く)、ダイナソーサファリ・バギーボルテージが対象。待ち時間が60分を超えた時点で現在スタンバイ列に並んでいる方、これから並びに来る方へ順次配布されます。
注意点
・アプリで取得できません。あくまでもスタンバイ列の方が対象。
・待ち時間が0になるわけではありません。記載の指定時間に戻ってきてからさらに最大で90分並びます。
・乗り終えるまで他のアトラクションの待ち列解放サービスは取得できません(この整理券を受け取る際に自身のチケットQRコードをスキャンされます)
・バギーボルテージは13時頃には配布終了となるので早めの取得を
パークの再入場は可能?
可能です。
入場ゲートまで戻り、近くのキャストに声を掛けると手の甲にスタンプを押してくれます。

パーク内の駐車場に車を停めている方はゲートを出ると目の前が駐車場なので待ち時間を車で過ごすこともできます。
再入場の際は1DayチケットのQRコード提示が必須なので注意してください。
他にも実際に足を運んで気づいたことなどまとめていますのでぜひ参考にしてください。
ジャングリア沖縄の注意点まとめてみました